PHP の設定項目 html_errors は、PHP がエラーを表示したりログに記録したりする際、そのエラーに関するドキュメントへのHTMLリンクを埋め込むかどうかを指定する項目です。
以下、php.ini 内のコメントの日本語訳です:
PHP がエラーを表示したりログに記録する際、そのエラーに関するドキュメントへの HTML リンクを挿入することができます。 この設定はエラーメッセージ中にそのような HTML リンクを表示するかどうかを制御します。 パフォーマンス上およびセキュリティ上の理由から、本番サーバー上ではこの設定を無効にする事が推奨されます。
注: この設定は、CLI SAPI では Off にハードコードされています。初期設定値: On 開発環境での推奨値: On 本番環境での推奨値: Offhttp://php.net/html-errors
公式マニュアルページ(日本語): PHP: 実行時設定 – Manual
上記コメント内の「CLI SAPI」というのは、CLI (Command Line Interface) SAPI (Server API) で、コマンドライン版のシェルアプリケーションを作成するための PHP ということらしいです。確かにシェルプログラムとして使用する場合には、リンクが出力されても困るので、php.ini の設定に関わらず HTML リンクは出力しないようになっているということですね。